Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,57■■■■□ 3,45
Trpm2Q91YD4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC36,56■■■■□ 3,44
Trpm2Q91YD4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Trpm2Q91YD4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC36,56■■■■□ 3,44
Trpm2Q91YD4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,55■■■■□ 3,44
Trpm2Q91YD4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,54■■■■□ 3,44
Trpm2Q91YD4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36,53■■■■□ 3,44
Trpm2Q91YD4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,52■■■■□ 3,44
Trpm2Q91YD4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,51■■■■□ 3,44
Trpm2Q91YD4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,44
Trpm2Q91YD4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Trpm2Q91YD4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,5■■■■□ 3,43
Trpm2Q91YD4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Trpm2Q91YD4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Trpm2Q91YD4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC36,48■■■■□ 3,43
Trpm2Q91YD4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC36,48■■■■□ 3,43
Trpm2Q91YD4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Trpm2Q91YD4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,47■■■■□ 3,43
Trpm2Q91YD4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,47■■■■□ 3,43
Trpm2Q91YD4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC36,44■■■■□ 3,42
Trpm2Q91YD4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36,44■■■■□ 3,42
Trpm2Q91YD4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC36,44■■■■□ 3,42
Trpm2Q91YD4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC36,43■■■■□ 3,42
Trpm2Q91YD4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,42■■■■□ 3,42
Trpm2Q91YD4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC36,42■■■■□ 3,42
Trpm2Q91YD4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC36,41■■■■□ 3,42
Trpm2Q91YD4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC36,41■■■■□ 3,42
Trpm2Q91YD4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36,41■■■■□ 3,42
Trpm2Q91YD4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC36,39■■■■□ 3,42
Trpm2Q91YD4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,39■■■■□ 3,42
Trpm2Q91YD4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Trpm2Q91YD4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Trpm2Q91YD4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC36,38■■■■□ 3,41
Trpm2Q91YD4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,37■■■■□ 3,41
Trpm2Q91YD4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Trpm2Q91YD4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Trpm2Q91YD4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC36,32■■■■□ 3,4
Trpm2Q91YD4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC36,31■■■■□ 3,4
Trpm2Q91YD4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Trpm2Q91YD4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
Trpm2Q91YD4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC36,29■■■■□ 3,4
Trpm2Q91YD4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC36,28■■■■□ 3,4
Trpm2Q91YD4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Trpm2Q91YD4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Trpm2Q91YD4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC36,25■■■■□ 3,39
Trpm2Q91YD4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC36,24■■■■□ 3,39
Trpm2Q91YD4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36,24■■■■□ 3,39
Trpm2Q91YD4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC36,24■■■■□ 3,39
Trpm2Q91YD4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Trpm2Q91YD4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Trpm2Q91YD4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Trpm2Q91YD4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC36,18■■■■□ 3,38
Trpm2Q91YD4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Trpm2Q91YD4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Trpm2Q91YD4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC36,15■■■■□ 3,38
Trpm2Q91YD4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Trpm2Q91YD4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,15■■■■□ 3,38
Trpm2Q91YD4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36,14■■■■□ 3,38
Trpm2Q91YD4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Trpm2Q91YD4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Trpm2Q91YD4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Trpm2Q91YD4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Trpm2Q91YD4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Trpm2Q91YD4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,08■■■■□ 3,37
Trpm2Q91YD4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,37
Trpm2Q91YD4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC36,07■■■■□ 3,37
Trpm2Q91YD4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Trpm2Q91YD4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,06■■■■□ 3,36
Trpm2Q91YD4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Trpm2Q91YD4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Trpm2Q91YD4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Trpm2Q91YD4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC36,03■■■■□ 3,36
Trpm2Q91YD4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Trpm2Q91YD4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Trpm2Q91YD4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Trpm2Q91YD4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Trpm2Q91YD4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Trpm2Q91YD4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Trpm2Q91YD4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Trpm2Q91YD4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Trpm2Q91YD4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35,96■■■■□ 3,35
Trpm2Q91YD4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,96■■■■□ 3,35
Trpm2Q91YD4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Trpm2Q91YD4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35,95■■■■□ 3,35
Trpm2Q91YD4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Trpm2Q91YD4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35,93■■■■□ 3,34
Trpm2Q91YD4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Trpm2Q91YD4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35,92■■■■□ 3,34
Trpm2Q91YD4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Trpm2Q91YD4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Trpm2Q91YD4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Trpm2Q91YD4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Trpm2Q91YD4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Trpm2Q91YD4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35,9■■■■□ 3,34
Trpm2Q91YD4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Trpm2Q91YD4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Trpm2Q91YD4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Trpm2Q91YD4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Trpm2Q91YD4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,86■■■■□ 3,33
Trpm2Q91YD4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,7 ms