Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y16

Pcdha3, Protocadherin alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha3Q91Y16 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdha3Q91Y16 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pcdha3Q91Y16 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdha3Q91Y16 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdha3Q91Y16 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdha3Q91Y16 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdha3Q91Y16 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pcdha3Q91Y16 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdha3Q91Y16 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pcdha3Q91Y16 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Pcdha3Q91Y16 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdha3Q91Y16 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdha3Q91Y16 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pcdha3Q91Y16 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pcdha3Q91Y16 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pcdha3Q91Y16 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pcdha3Q91Y16 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdha3Q91Y16 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdha3Q91Y16 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pcdha3Q91Y16 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pcdha3Q91Y16 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdha3Q91Y16 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pcdha3Q91Y16 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pcdha3Q91Y16 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pcdha3Q91Y16 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdha3Q91Y16 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pcdha3Q91Y16 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pcdha3Q91Y16 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pcdha3Q91Y16 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdha3Q91Y16 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pcdha3Q91Y16 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pcdha3Q91Y16 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdha3Q91Y16 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pcdha3Q91Y16 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdha3Q91Y16 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pcdha3Q91Y16 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdha3Q91Y16 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pcdha3Q91Y16 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pcdha3Q91Y16 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pcdha3Q91Y16 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha3Q91Y16 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha3Q91Y16 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha3Q91Y16 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha3Q91Y16 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pcdha3Q91Y16 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pcdha3Q91Y16 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pcdha3Q91Y16 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdha3Q91Y16 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdha3Q91Y16 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pcdha3Q91Y16 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pcdha3Q91Y16 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms