Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCX2

Slc35c2, Solute carrier family 35 member C2, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35c2Q8VCX2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slc35c2Q8VCX2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc35c2Q8VCX2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slc35c2Q8VCX2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc35c2Q8VCX2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc35c2Q8VCX2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc35c2Q8VCX2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc35c2Q8VCX2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc35c2Q8VCX2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc35c2Q8VCX2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc35c2Q8VCX2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc35c2Q8VCX2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc35c2Q8VCX2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc35c2Q8VCX2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc35c2Q8VCX2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35c2Q8VCX2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc35c2Q8VCX2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc35c2Q8VCX2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc35c2Q8VCX2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc35c2Q8VCX2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc35c2Q8VCX2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35c2Q8VCX2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35c2Q8VCX2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35c2Q8VCX2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc35c2Q8VCX2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc35c2Q8VCX2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc35c2Q8VCX2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc35c2Q8VCX2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc35c2Q8VCX2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc35c2Q8VCX2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc35c2Q8VCX2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc35c2Q8VCX2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc35c2Q8VCX2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc35c2Q8VCX2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc35c2Q8VCX2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc35c2Q8VCX2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc35c2Q8VCX2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc35c2Q8VCX2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms