Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Krt25Q8VCW2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Krt25Q8VCW2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Krt25Q8VCW2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Krt25Q8VCW2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Krt25Q8VCW2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Krt25Q8VCW2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Krt25Q8VCW2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Krt25Q8VCW2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Krt25Q8VCW2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Krt25Q8VCW2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Krt25Q8VCW2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Krt25Q8VCW2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Krt25Q8VCW2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Krt25Q8VCW2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Krt25Q8VCW2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Krt25Q8VCW2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Krt25Q8VCW2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Krt25Q8VCW2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Krt25Q8VCW2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Krt25Q8VCW2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Krt25Q8VCW2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Krt25Q8VCW2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Krt25Q8VCW2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Krt25Q8VCW2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Krt25Q8VCW2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Krt25Q8VCW2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Krt25Q8VCW2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
Krt25Q8VCW2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Krt25Q8VCW2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Krt25Q8VCW2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Krt25Q8VCW2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Krt25Q8VCW2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Krt25Q8VCW2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Krt25Q8VCW2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Krt25Q8VCW2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Krt25Q8VCW2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Krt25Q8VCW2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Krt25Q8VCW2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Krt25Q8VCW2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Krt25Q8VCW2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Krt25Q8VCW2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Krt25Q8VCW2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Krt25Q8VCW2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Krt25Q8VCW2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Krt25Q8VCW2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Krt25Q8VCW2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Krt25Q8VCW2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Krt25Q8VCW2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Krt25Q8VCW2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Krt25Q8VCW2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Krt25Q8VCW2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Krt25Q8VCW2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Krt25Q8VCW2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Krt25Q8VCW2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Krt25Q8VCW2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Krt25Q8VCW2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Krt25Q8VCW2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Krt25Q8VCW2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Krt25Q8VCW2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Krt25Q8VCW2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Krt25Q8VCW2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Krt25Q8VCW2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Krt25Q8VCW2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms