Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC1

Hpgd, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpgdQ8VCC1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HpgdQ8VCC1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HpgdQ8VCC1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HpgdQ8VCC1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HpgdQ8VCC1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HpgdQ8VCC1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HpgdQ8VCC1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HpgdQ8VCC1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HpgdQ8VCC1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HpgdQ8VCC1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HpgdQ8VCC1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HpgdQ8VCC1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HpgdQ8VCC1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HpgdQ8VCC1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HpgdQ8VCC1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HpgdQ8VCC1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
HpgdQ8VCC1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HpgdQ8VCC1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HpgdQ8VCC1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpgdQ8VCC1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpgdQ8VCC1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpgdQ8VCC1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HpgdQ8VCC1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HpgdQ8VCC1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HpgdQ8VCC1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HpgdQ8VCC1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HpgdQ8VCC1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HpgdQ8VCC1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HpgdQ8VCC1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HpgdQ8VCC1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HpgdQ8VCC1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HpgdQ8VCC1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HpgdQ8VCC1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HpgdQ8VCC1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms