Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B7

Brd8, Bromodomain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd8Q8R3B7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Brd8Q8R3B7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Brd8Q8R3B7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Brd8Q8R3B7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Brd8Q8R3B7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd8Q8R3B7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd8Q8R3B7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Brd8Q8R3B7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd8Q8R3B7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd8Q8R3B7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Brd8Q8R3B7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Brd8Q8R3B7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brd8Q8R3B7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Brd8Q8R3B7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brd8Q8R3B7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brd8Q8R3B7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brd8Q8R3B7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd8Q8R3B7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brd8Q8R3B7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brd8Q8R3B7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brd8Q8R3B7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd8Q8R3B7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd8Q8R3B7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brd8Q8R3B7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Brd8Q8R3B7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brd8Q8R3B7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd8Q8R3B7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brd8Q8R3B7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd8Q8R3B7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brd8Q8R3B7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.7 ms