Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rab11fip5Q8R361 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip5Q8R361 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip5Q8R361 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip5Q8R361 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rab11fip5Q8R361 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip5Q8R361 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip5Q8R361 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rab11fip5Q8R361 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip5Q8R361 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip5Q8R361 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip5Q8R361 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rab11fip5Q8R361 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip5Q8R361 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rab11fip5Q8R361 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rab11fip5Q8R361 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rab11fip5Q8R361 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rab11fip5Q8R361 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rab11fip5Q8R361 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rab11fip5Q8R361 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms