Protein–RNA interactions for Protein: Q8K485

Kctd11, BTB/POZ domain-containing protein KCTD11, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd11Q8K485 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Kctd11Q8K485 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kctd11Q8K485 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kctd11Q8K485 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kctd11Q8K485 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd11Q8K485 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kctd11Q8K485 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd11Q8K485 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd11Q8K485 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kctd11Q8K485 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd11Q8K485 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kctd11Q8K485 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kctd11Q8K485 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd11Q8K485 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kctd11Q8K485 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd11Q8K485 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kctd11Q8K485 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd11Q8K485 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd11Q8K485 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kctd11Q8K485 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd11Q8K485 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd11Q8K485 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kctd11Q8K485 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd11Q8K485 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd11Q8K485 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd11Q8K485 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kctd11Q8K485 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Kctd11Q8K485 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd11Q8K485 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kctd11Q8K485 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd11Q8K485 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms