Protein–RNA interactions for Protein: Q8K211

Slc31a1, High affinity copper uptake protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc31a1Q8K211 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc31a1Q8K211 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc31a1Q8K211 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc31a1Q8K211 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc31a1Q8K211 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc31a1Q8K211 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc31a1Q8K211 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc31a1Q8K211 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc31a1Q8K211 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc31a1Q8K211 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc31a1Q8K211 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc31a1Q8K211 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc31a1Q8K211 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc31a1Q8K211 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc31a1Q8K211 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc31a1Q8K211 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc31a1Q8K211 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc31a1Q8K211 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc31a1Q8K211 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms