Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E3

Slc5a11, Sodium/myo-inositol cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a11Q8K0E3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc5a11Q8K0E3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc5a11Q8K0E3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc5a11Q8K0E3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slc5a11Q8K0E3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Slc5a11Q8K0E3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slc5a11Q8K0E3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a11Q8K0E3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a11Q8K0E3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a11Q8K0E3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Slc5a11Q8K0E3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms