Protein–RNA interactions for Protein: Q8K004

Spata2, Spermatogenesis-associated 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata2Q8K004 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Spata2Q8K004 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spata2Q8K004 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Spata2Q8K004 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Spata2Q8K004 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spata2Q8K004 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spata2Q8K004 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spata2Q8K004 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spata2Q8K004 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Spata2Q8K004 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spata2Q8K004 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spata2Q8K004 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spata2Q8K004 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spata2Q8K004 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spata2Q8K004 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spata2Q8K004 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spata2Q8K004 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spata2Q8K004 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spata2Q8K004 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spata2Q8K004 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spata2Q8K004 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spata2Q8K004 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Spata2Q8K004 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata2Q8K004 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata2Q8K004 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata2Q8K004 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spata2Q8K004 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spata2Q8K004 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spata2Q8K004 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spata2Q8K004 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spata2Q8K004 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spata2Q8K004 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spata2Q8K004 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spata2Q8K004 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Spata2Q8K004 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Spata2Q8K004 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Spata2Q8K004 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms