Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpne5Q8JZW4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpne5Q8JZW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cpne5Q8JZW4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cpne5Q8JZW4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cpne5Q8JZW4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne5Q8JZW4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne5Q8JZW4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cpne5Q8JZW4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne5Q8JZW4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne5Q8JZW4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne5Q8JZW4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne5Q8JZW4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cpne5Q8JZW4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne5Q8JZW4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne5Q8JZW4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne5Q8JZW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cpne5Q8JZW4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cpne5Q8JZW4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cpne5Q8JZW4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne5Q8JZW4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne5Q8JZW4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne5Q8JZW4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne5Q8JZW4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cpne5Q8JZW4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne5Q8JZW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne5Q8JZW4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne5Q8JZW4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cpne5Q8JZW4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cpne5Q8JZW4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms