Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIP4

Mark4, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark4Q8CIP4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mark4Q8CIP4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mark4Q8CIP4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mark4Q8CIP4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mark4Q8CIP4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mark4Q8CIP4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mark4Q8CIP4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mark4Q8CIP4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mark4Q8CIP4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mark4Q8CIP4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mark4Q8CIP4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mark4Q8CIP4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mark4Q8CIP4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mark4Q8CIP4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mark4Q8CIP4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms