Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mterf1aQ8CHZ9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mterf1aQ8CHZ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mterf1aQ8CHZ9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mterf1aQ8CHZ9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mterf1aQ8CHZ9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mterf1aQ8CHZ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mterf1aQ8CHZ9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Mterf1aQ8CHZ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mterf1aQ8CHZ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mterf1aQ8CHZ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mterf1aQ8CHZ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mterf1aQ8CHZ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mterf1aQ8CHZ9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mterf1aQ8CHZ9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mterf1aQ8CHZ9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mterf1aQ8CHZ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mterf1aQ8CHZ9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mterf1aQ8CHZ9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mterf1aQ8CHZ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mterf1aQ8CHZ9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mterf1aQ8CHZ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mterf1aQ8CHZ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mterf1aQ8CHZ9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mterf1aQ8CHZ9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mterf1aQ8CHZ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mterf1aQ8CHZ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mterf1aQ8CHZ9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mterf1aQ8CHZ9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Mterf1aQ8CHZ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mterf1aQ8CHZ9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Mterf1aQ8CHZ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mterf1aQ8CHZ9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mterf1aQ8CHZ9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mterf1aQ8CHZ9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mterf1aQ8CHZ9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mterf1aQ8CHZ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mterf1aQ8CHZ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mterf1aQ8CHZ9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mterf1aQ8CHZ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mterf1aQ8CHZ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mterf1aQ8CHZ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mterf1aQ8CHZ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mterf1aQ8CHZ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mterf1aQ8CHZ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mterf1aQ8CHZ9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mterf1aQ8CHZ9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mterf1aQ8CHZ9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mterf1aQ8CHZ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mterf1aQ8CHZ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mterf1aQ8CHZ9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mterf1aQ8CHZ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mterf1aQ8CHZ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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