Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI0

Nedd4l, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4lQ8CFI0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nedd4lQ8CFI0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4lQ8CFI0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nedd4lQ8CFI0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4lQ8CFI0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nedd4lQ8CFI0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd4lQ8CFI0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd4lQ8CFI0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nedd4lQ8CFI0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4lQ8CFI0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nedd4lQ8CFI0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd4lQ8CFI0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nedd4lQ8CFI0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nedd4lQ8CFI0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nedd4lQ8CFI0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nedd4lQ8CFI0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd4lQ8CFI0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd4lQ8CFI0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd4lQ8CFI0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd4lQ8CFI0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nedd4lQ8CFI0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4lQ8CFI0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nedd4lQ8CFI0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nedd4lQ8CFI0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4lQ8CFI0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nedd4lQ8CFI0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4lQ8CFI0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nedd4lQ8CFI0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms