Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Klhl11Q8CE33 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Klhl11Q8CE33 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Klhl11Q8CE33 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Klhl11Q8CE33 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl11Q8CE33 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Klhl11Q8CE33 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klhl11Q8CE33 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Klhl11Q8CE33 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Klhl11Q8CE33 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klhl11Q8CE33 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Klhl11Q8CE33 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klhl11Q8CE33 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klhl11Q8CE33 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Klhl11Q8CE33 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Klhl11Q8CE33 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Klhl11Q8CE33 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl11Q8CE33 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl11Q8CE33 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Klhl11Q8CE33 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Klhl11Q8CE33 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Klhl11Q8CE33 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhl11Q8CE33 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Klhl11Q8CE33 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhl11Q8CE33 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhl11Q8CE33 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Klhl11Q8CE33 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Klhl11Q8CE33 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Klhl11Q8CE33 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhl11Q8CE33 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhl11Q8CE33 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhl11Q8CE33 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Klhl11Q8CE33 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Klhl11Q8CE33 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Klhl11Q8CE33 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl11Q8CE33 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl11Q8CE33 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl11Q8CE33 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Klhl11Q8CE33 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhl11Q8CE33 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Klhl11Q8CE33 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Klhl11Q8CE33 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Klhl11Q8CE33 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhl11Q8CE33 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhl11Q8CE33 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhl11Q8CE33 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhl11Q8CE33 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Klhl11Q8CE33 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhl11Q8CE33 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhl11Q8CE33 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Klhl11Q8CE33 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhl11Q8CE33 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Klhl11Q8CE33 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhl11Q8CE33 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhl11Q8CE33 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Klhl11Q8CE33 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Klhl11Q8CE33 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhl11Q8CE33 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Klhl11Q8CE33 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl11Q8CE33 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl11Q8CE33 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl11Q8CE33 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Klhl11Q8CE33 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl11Q8CE33 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Klhl11Q8CE33 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl11Q8CE33 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Klhl11Q8CE33 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Klhl11Q8CE33 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Klhl11Q8CE33 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl11Q8CE33 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl11Q8CE33 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl11Q8CE33 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Klhl11Q8CE33 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Klhl11Q8CE33 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Klhl11Q8CE33 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl11Q8CE33 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Klhl11Q8CE33 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Klhl11Q8CE33 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Klhl11Q8CE33 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Klhl11Q8CE33 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Klhl11Q8CE33 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Klhl11Q8CE33 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl11Q8CE33 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Klhl11Q8CE33 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms