Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc178Q8CDV0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc178Q8CDV0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc178Q8CDV0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc178Q8CDV0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc178Q8CDV0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc178Q8CDV0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc178Q8CDV0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc178Q8CDV0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccdc178Q8CDV0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc178Q8CDV0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc178Q8CDV0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc178Q8CDV0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc178Q8CDV0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc178Q8CDV0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc178Q8CDV0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc178Q8CDV0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc178Q8CDV0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc178Q8CDV0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc178Q8CDV0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc178Q8CDV0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc178Q8CDV0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc178Q8CDV0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc178Q8CDV0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc178Q8CDV0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc178Q8CDV0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc178Q8CDV0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc178Q8CDV0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc178Q8CDV0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc178Q8CDV0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc178Q8CDV0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc178Q8CDV0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc178Q8CDV0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc178Q8CDV0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc178Q8CDV0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc178Q8CDV0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc178Q8CDV0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc178Q8CDV0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc178Q8CDV0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc178Q8CDV0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc178Q8CDV0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc178Q8CDV0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc178Q8CDV0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc178Q8CDV0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc178Q8CDV0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc178Q8CDV0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc178Q8CDV0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc178Q8CDV0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc178Q8CDV0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc178Q8CDV0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc178Q8CDV0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc178Q8CDV0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc178Q8CDV0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc178Q8CDV0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc178Q8CDV0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc178Q8CDV0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc178Q8CDV0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc178Q8CDV0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc178Q8CDV0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc178Q8CDV0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc178Q8CDV0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms