Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Ccdc38Q8CDN8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ccdc38Q8CDN8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Ccdc38Q8CDN8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ccdc38Q8CDN8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ccdc38Q8CDN8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Ccdc38Q8CDN8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Ccdc38Q8CDN8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ccdc38Q8CDN8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ccdc38Q8CDN8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ccdc38Q8CDN8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ccdc38Q8CDN8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Ccdc38Q8CDN8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc38Q8CDN8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc38Q8CDN8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Ccdc38Q8CDN8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Ccdc38Q8CDN8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ccdc38Q8CDN8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Ccdc38Q8CDN8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ccdc38Q8CDN8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ccdc38Q8CDN8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc38Q8CDN8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Ccdc38Q8CDN8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Ccdc38Q8CDN8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ccdc38Q8CDN8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ccdc38Q8CDN8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ccdc38Q8CDN8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ccdc38Q8CDN8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc38Q8CDN8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc38Q8CDN8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc38Q8CDN8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc38Q8CDN8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Ccdc38Q8CDN8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26,89■■□□□ 1,9
Ccdc38Q8CDN8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26,89■■□□□ 1,9
Ccdc38Q8CDN8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ccdc38Q8CDN8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ccdc38Q8CDN8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ccdc38Q8CDN8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ccdc38Q8CDN8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ccdc38Q8CDN8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ccdc38Q8CDN8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ccdc38Q8CDN8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc38Q8CDN8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc38Q8CDN8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc38Q8CDN8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26,81■■□□□ 1,88
Ccdc38Q8CDN8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ccdc38Q8CDN8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ccdc38Q8CDN8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ccdc38Q8CDN8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Ccdc38Q8CDN8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,76■■□□□ 1,88
Ccdc38Q8CDN8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26,76■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26,74■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26,71■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Ccdc38Q8CDN8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Ccdc38Q8CDN8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
Ccdc38Q8CDN8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Ccdc38Q8CDN8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Ccdc38Q8CDN8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Ccdc38Q8CDN8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Ccdc38Q8CDN8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26,68■■□□□ 1,86
Ccdc38Q8CDN8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Ccdc38Q8CDN8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Ccdc38Q8CDN8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ccdc38Q8CDN8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ccdc38Q8CDN8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Ccdc38Q8CDN8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Ccdc38Q8CDN8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Ccdc38Q8CDN8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26,64■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,61■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,6■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Ccdc38Q8CDN8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26,57■■□□□ 1,84
Ccdc38Q8CDN8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Ccdc38Q8CDN8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Ccdc38Q8CDN8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms