Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
E4f1Q8CCE9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
E4f1Q8CCE9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
E4f1Q8CCE9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
E4f1Q8CCE9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
E4f1Q8CCE9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E4f1Q8CCE9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
E4f1Q8CCE9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
E4f1Q8CCE9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
E4f1Q8CCE9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
E4f1Q8CCE9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
E4f1Q8CCE9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
E4f1Q8CCE9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
E4f1Q8CCE9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
E4f1Q8CCE9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
E4f1Q8CCE9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
E4f1Q8CCE9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
E4f1Q8CCE9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
E4f1Q8CCE9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
E4f1Q8CCE9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
E4f1Q8CCE9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
E4f1Q8CCE9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
E4f1Q8CCE9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
E4f1Q8CCE9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
E4f1Q8CCE9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
E4f1Q8CCE9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
E4f1Q8CCE9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
E4f1Q8CCE9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
E4f1Q8CCE9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
E4f1Q8CCE9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
E4f1Q8CCE9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
E4f1Q8CCE9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
E4f1Q8CCE9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
E4f1Q8CCE9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
E4f1Q8CCE9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
E4f1Q8CCE9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
E4f1Q8CCE9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
E4f1Q8CCE9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
E4f1Q8CCE9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms