Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc159Q8C963 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc159Q8C963 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc159Q8C963 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc159Q8C963 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc159Q8C963 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc159Q8C963 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ccdc159Q8C963 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc159Q8C963 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc159Q8C963 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc159Q8C963 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc159Q8C963 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc159Q8C963 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc159Q8C963 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms