Protein–RNA interactions for Protein: Q8C850

Scara3, Scavenger receptor class A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara3Q8C850 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scara3Q8C850 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scara3Q8C850 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scara3Q8C850 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scara3Q8C850 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scara3Q8C850 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scara3Q8C850 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scara3Q8C850 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scara3Q8C850 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scara3Q8C850 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scara3Q8C850 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scara3Q8C850 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scara3Q8C850 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scara3Q8C850 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scara3Q8C850 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scara3Q8C850 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scara3Q8C850 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scara3Q8C850 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scara3Q8C850 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Scara3Q8C850 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Scara3Q8C850 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scara3Q8C850 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scara3Q8C850 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Scara3Q8C850 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scara3Q8C850 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scara3Q8C850 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scara3Q8C850 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scara3Q8C850 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scara3Q8C850 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scara3Q8C850 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scara3Q8C850 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scara3Q8C850 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Scara3Q8C850 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scara3Q8C850 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scara3Q8C850 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scara3Q8C850 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scara3Q8C850 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scara3Q8C850 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scara3Q8C850 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scara3Q8C850 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scara3Q8C850 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scara3Q8C850 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scara3Q8C850 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Scara3Q8C850 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scara3Q8C850 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scara3Q8C850 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Scara3Q8C850 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Scara3Q8C850 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Scara3Q8C850 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scara3Q8C850 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scara3Q8C850 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scara3Q8C850 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scara3Q8C850 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Scara3Q8C850 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scara3Q8C850 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scara3Q8C850 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Scara3Q8C850 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scara3Q8C850 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scara3Q8C850 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scara3Q8C850 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scara3Q8C850 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scara3Q8C850 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scara3Q8C850 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scara3Q8C850 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Scara3Q8C850 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scara3Q8C850 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scara3Q8C850 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scara3Q8C850 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scara3Q8C850 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scara3Q8C850 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Scara3Q8C850 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scara3Q8C850 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scara3Q8C850 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scara3Q8C850 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scara3Q8C850 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scara3Q8C850 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scara3Q8C850 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scara3Q8C850 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scara3Q8C850 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scara3Q8C850 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scara3Q8C850 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scara3Q8C850 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scara3Q8C850 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms