Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg16l1Q8C0J2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg16l1Q8C0J2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Atg16l1Q8C0J2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg16l1Q8C0J2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atg16l1Q8C0J2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atg16l1Q8C0J2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atg16l1Q8C0J2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg16l1Q8C0J2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Atg16l1Q8C0J2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atg16l1Q8C0J2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg16l1Q8C0J2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg16l1Q8C0J2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg16l1Q8C0J2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atg16l1Q8C0J2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atg16l1Q8C0J2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg16l1Q8C0J2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg16l1Q8C0J2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atg16l1Q8C0J2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Atg16l1Q8C0J2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atg16l1Q8C0J2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg16l1Q8C0J2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg16l1Q8C0J2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atg16l1Q8C0J2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg16l1Q8C0J2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg16l1Q8C0J2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg16l1Q8C0J2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atg16l1Q8C0J2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atg16l1Q8C0J2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg16l1Q8C0J2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg16l1Q8C0J2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg16l1Q8C0J2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atg16l1Q8C0J2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Atg16l1Q8C0J2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atg16l1Q8C0J2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg16l1Q8C0J2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atg16l1Q8C0J2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg16l1Q8C0J2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg16l1Q8C0J2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atg16l1Q8C0J2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg16l1Q8C0J2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg16l1Q8C0J2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atg16l1Q8C0J2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg16l1Q8C0J2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms