Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY89

Slc44a2, Choline transporter-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a2Q8BY89 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a2Q8BY89 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc44a2Q8BY89 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc44a2Q8BY89 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a2Q8BY89 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Slc44a2Q8BY89 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc44a2Q8BY89 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc44a2Q8BY89 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc44a2Q8BY89 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc44a2Q8BY89 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc44a2Q8BY89 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc44a2Q8BY89 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc44a2Q8BY89 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a2Q8BY89 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a2Q8BY89 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a2Q8BY89 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc44a2Q8BY89 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slc44a2Q8BY89 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slc44a2Q8BY89 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc44a2Q8BY89 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slc44a2Q8BY89 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slc44a2Q8BY89 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc44a2Q8BY89 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slc44a2Q8BY89 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a2Q8BY89 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a2Q8BY89 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slc44a2Q8BY89 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a2Q8BY89 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slc44a2Q8BY89 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a2Q8BY89 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slc44a2Q8BY89 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slc44a2Q8BY89 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slc44a2Q8BY89 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slc44a2Q8BY89 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms