Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vps13cQ8BX70 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vps13cQ8BX70 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vps13cQ8BX70 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vps13cQ8BX70 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vps13cQ8BX70 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps13cQ8BX70 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vps13cQ8BX70 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vps13cQ8BX70 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps13cQ8BX70 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vps13cQ8BX70 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vps13cQ8BX70 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vps13cQ8BX70 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps13cQ8BX70 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vps13cQ8BX70 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps13cQ8BX70 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vps13cQ8BX70 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps13cQ8BX70 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps13cQ8BX70 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps13cQ8BX70 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps13cQ8BX70 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Vps13cQ8BX70 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vps13cQ8BX70 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps13cQ8BX70 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vps13cQ8BX70 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Vps13cQ8BX70 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps13cQ8BX70 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps13cQ8BX70 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vps13cQ8BX70 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps13cQ8BX70 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Vps13cQ8BX70 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vps13cQ8BX70 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps13cQ8BX70 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vps13cQ8BX70 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vps13cQ8BX70 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vps13cQ8BX70 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vps13cQ8BX70 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps13cQ8BX70 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vps13cQ8BX70 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vps13cQ8BX70 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vps13cQ8BX70 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms