Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU40

Nlrp4a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4aQ8BU40 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp4aQ8BU40 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp4aQ8BU40 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp4aQ8BU40 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp4aQ8BU40 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp4aQ8BU40 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp4aQ8BU40 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp4aQ8BU40 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp4aQ8BU40 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp4aQ8BU40 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp4aQ8BU40 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp4aQ8BU40 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp4aQ8BU40 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp4aQ8BU40 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp4aQ8BU40 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nlrp4aQ8BU40 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp4aQ8BU40 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp4aQ8BU40 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp4aQ8BU40 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp4aQ8BU40 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp4aQ8BU40 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp4aQ8BU40 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp4aQ8BU40 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp4aQ8BU40 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp4aQ8BU40 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp4aQ8BU40 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp4aQ8BU40 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp4aQ8BU40 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nlrp4aQ8BU40 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrp4aQ8BU40 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrp4aQ8BU40 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrp4aQ8BU40 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrp4aQ8BU40 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nlrp4aQ8BU40 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrp4aQ8BU40 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrp4aQ8BU40 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrp4aQ8BU40 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrp4aQ8BU40 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp4aQ8BU40 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp4aQ8BU40 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp4aQ8BU40 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp4aQ8BU40 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Nlrp4aQ8BU40 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nlrp4aQ8BU40 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrp4aQ8BU40 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrp4aQ8BU40 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrp4aQ8BU40 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp4aQ8BU40 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp4aQ8BU40 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp4aQ8BU40 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4aQ8BU40 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp4aQ8BU40 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp4aQ8BU40 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp4aQ8BU40 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4aQ8BU40 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4aQ8BU40 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp4aQ8BU40 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp4aQ8BU40 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp4aQ8BU40 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp4aQ8BU40 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp4aQ8BU40 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp4aQ8BU40 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nlrp4aQ8BU40 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp4aQ8BU40 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nlrp4aQ8BU40 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4aQ8BU40 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4aQ8BU40 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nlrp4aQ8BU40 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp4aQ8BU40 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Nlrp4aQ8BU40 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp4aQ8BU40 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp4aQ8BU40 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nlrp4aQ8BU40 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp4aQ8BU40 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp4aQ8BU40 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nlrp4aQ8BU40 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nlrp4aQ8BU40 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nlrp4aQ8BU40 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp4aQ8BU40 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nlrp4aQ8BU40 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp4aQ8BU40 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp4aQ8BU40 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nlrp4aQ8BU40 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148 ms