Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTW9

Pak4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pak4Q8BTW9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pak4Q8BTW9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pak4Q8BTW9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pak4Q8BTW9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pak4Q8BTW9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pak4Q8BTW9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pak4Q8BTW9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pak4Q8BTW9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pak4Q8BTW9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pak4Q8BTW9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pak4Q8BTW9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pak4Q8BTW9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pak4Q8BTW9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pak4Q8BTW9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pak4Q8BTW9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pak4Q8BTW9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pak4Q8BTW9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pak4Q8BTW9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pak4Q8BTW9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pak4Q8BTW9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pak4Q8BTW9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pak4Q8BTW9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pak4Q8BTW9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pak4Q8BTW9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pak4Q8BTW9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pak4Q8BTW9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pak4Q8BTW9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pak4Q8BTW9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pak4Q8BTW9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pak4Q8BTW9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pak4Q8BTW9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pak4Q8BTW9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pak4Q8BTW9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pak4Q8BTW9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pak4Q8BTW9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pak4Q8BTW9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pak4Q8BTW9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pak4Q8BTW9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pak4Q8BTW9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pak4Q8BTW9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pak4Q8BTW9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pak4Q8BTW9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pak4Q8BTW9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pak4Q8BTW9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pak4Q8BTW9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pak4Q8BTW9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pak4Q8BTW9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pak4Q8BTW9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms