Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTR5

Dusp28, Dual specificity phosphatase 28, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp28Q8BTR5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dusp28Q8BTR5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dusp28Q8BTR5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Dusp28Q8BTR5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dusp28Q8BTR5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dusp28Q8BTR5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dusp28Q8BTR5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dusp28Q8BTR5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dusp28Q8BTR5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dusp28Q8BTR5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Dusp28Q8BTR5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dusp28Q8BTR5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dusp28Q8BTR5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dusp28Q8BTR5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dusp28Q8BTR5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dusp28Q8BTR5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dusp28Q8BTR5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dusp28Q8BTR5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dusp28Q8BTR5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dusp28Q8BTR5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dusp28Q8BTR5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dusp28Q8BTR5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dusp28Q8BTR5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dusp28Q8BTR5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dusp28Q8BTR5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dusp28Q8BTR5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dusp28Q8BTR5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dusp28Q8BTR5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dusp28Q8BTR5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dusp28Q8BTR5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dusp28Q8BTR5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dusp28Q8BTR5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dusp28Q8BTR5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dusp28Q8BTR5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dusp28Q8BTR5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms