Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gga3Q8BMI3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gga3Q8BMI3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gga3Q8BMI3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Gga3Q8BMI3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gga3Q8BMI3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gga3Q8BMI3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gga3Q8BMI3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gga3Q8BMI3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gga3Q8BMI3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gga3Q8BMI3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gga3Q8BMI3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gga3Q8BMI3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gga3Q8BMI3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gga3Q8BMI3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gga3Q8BMI3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gga3Q8BMI3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gga3Q8BMI3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gga3Q8BMI3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gga3Q8BMI3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gga3Q8BMI3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Gga3Q8BMI3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gga3Q8BMI3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gga3Q8BMI3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gga3Q8BMI3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gga3Q8BMI3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gga3Q8BMI3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gga3Q8BMI3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Gga3Q8BMI3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Gga3Q8BMI3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gga3Q8BMI3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gga3Q8BMI3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gga3Q8BMI3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gga3Q8BMI3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gga3Q8BMI3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gga3Q8BMI3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gga3Q8BMI3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gga3Q8BMI3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Gga3Q8BMI3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gga3Q8BMI3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gga3Q8BMI3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gga3Q8BMI3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Gga3Q8BMI3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gga3Q8BMI3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Gga3Q8BMI3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gga3Q8BMI3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms