Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLK3

Lsamp, Limbic system-associated membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LsampQ8BLK3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LsampQ8BLK3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LsampQ8BLK3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LsampQ8BLK3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LsampQ8BLK3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LsampQ8BLK3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LsampQ8BLK3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LsampQ8BLK3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LsampQ8BLK3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LsampQ8BLK3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LsampQ8BLK3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LsampQ8BLK3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LsampQ8BLK3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LsampQ8BLK3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LsampQ8BLK3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LsampQ8BLK3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LsampQ8BLK3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LsampQ8BLK3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LsampQ8BLK3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LsampQ8BLK3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LsampQ8BLK3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LsampQ8BLK3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LsampQ8BLK3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LsampQ8BLK3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LsampQ8BLK3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LsampQ8BLK3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LsampQ8BLK3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LsampQ8BLK3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LsampQ8BLK3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LsampQ8BLK3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LsampQ8BLK3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LsampQ8BLK3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LsampQ8BLK3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LsampQ8BLK3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LsampQ8BLK3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LsampQ8BLK3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LsampQ8BLK3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LsampQ8BLK3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms