Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJF9

Chmp2b, Charged multivesicular body protein 2b, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2bQ8BJF9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp2bQ8BJF9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp2bQ8BJF9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Chmp2bQ8BJF9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp2bQ8BJF9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Chmp2bQ8BJF9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp2bQ8BJF9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp2bQ8BJF9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp2bQ8BJF9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Chmp2bQ8BJF9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp2bQ8BJF9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp2bQ8BJF9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Chmp2bQ8BJF9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Chmp2bQ8BJF9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chmp2bQ8BJF9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp2bQ8BJF9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Chmp2bQ8BJF9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp2bQ8BJF9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp2bQ8BJF9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chmp2bQ8BJF9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp2bQ8BJF9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chmp2bQ8BJF9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp2bQ8BJF9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp2bQ8BJF9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chmp2bQ8BJF9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp2bQ8BJF9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chmp2bQ8BJF9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chmp2bQ8BJF9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chmp2bQ8BJF9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Chmp2bQ8BJF9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chmp2bQ8BJF9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp2bQ8BJF9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp2bQ8BJF9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp2bQ8BJF9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Chmp2bQ8BJF9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp2bQ8BJF9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp2bQ8BJF9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp2bQ8BJF9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Chmp2bQ8BJF9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp2bQ8BJF9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Chmp2bQ8BJF9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp2bQ8BJF9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Chmp2bQ8BJF9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Chmp2bQ8BJF9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp2bQ8BJF9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp2bQ8BJF9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Chmp2bQ8BJF9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp2bQ8BJF9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp2bQ8BJF9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Chmp2bQ8BJF9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp2bQ8BJF9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp2bQ8BJF9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp2bQ8BJF9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Chmp2bQ8BJF9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp2bQ8BJF9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Chmp2bQ8BJF9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Chmp2bQ8BJF9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Chmp2bQ8BJF9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms