Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmd4aQ8BIE6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmd4aQ8BIE6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmd4aQ8BIE6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Frmd4aQ8BIE6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Frmd4aQ8BIE6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Frmd4aQ8BIE6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Frmd4aQ8BIE6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmd4aQ8BIE6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmd4aQ8BIE6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmd4aQ8BIE6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Frmd4aQ8BIE6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Frmd4aQ8BIE6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Frmd4aQ8BIE6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmd4aQ8BIE6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmd4aQ8BIE6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmd4aQ8BIE6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Frmd4aQ8BIE6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Frmd4aQ8BIE6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmd4aQ8BIE6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Frmd4aQ8BIE6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd4aQ8BIE6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Frmd4aQ8BIE6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Frmd4aQ8BIE6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmd4aQ8BIE6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmd4aQ8BIE6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmd4aQ8BIE6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmd4aQ8BIE6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Frmd4aQ8BIE6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmd4aQ8BIE6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Frmd4aQ8BIE6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmd4aQ8BIE6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Frmd4aQ8BIE6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmd4aQ8BIE6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Frmd4aQ8BIE6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Frmd4aQ8BIE6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Frmd4aQ8BIE6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmd4aQ8BIE6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmd4aQ8BIE6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Frmd4aQ8BIE6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmd4aQ8BIE6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmd4aQ8BIE6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Frmd4aQ8BIE6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmd4aQ8BIE6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Frmd4aQ8BIE6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmd4aQ8BIE6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Frmd4aQ8BIE6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmd4aQ8BIE6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Frmd4aQ8BIE6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Frmd4aQ8BIE6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Frmd4aQ8BIE6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Frmd4aQ8BIE6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms