Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH74

Nup107, Nuclear pore complex protein Nup107, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup107Q8BH74 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nup107Q8BH74 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nup107Q8BH74 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nup107Q8BH74 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup107Q8BH74 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nup107Q8BH74 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup107Q8BH74 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms