Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG16

Slc6a15, Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT2, mousemouse

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a15Q8BG16 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc6a15Q8BG16 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc6a15Q8BG16 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc6a15Q8BG16 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a15Q8BG16 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a15Q8BG16 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a15Q8BG16 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms