Protein–RNA interactions for Protein: Q811W2

Cyp26b1, Cytochrome P450 26B1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26b1Q811W2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cyp26b1Q811W2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyp26b1Q811W2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cyp26b1Q811W2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cyp26b1Q811W2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cyp26b1Q811W2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp26b1Q811W2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp26b1Q811W2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp26b1Q811W2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cyp26b1Q811W2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp26b1Q811W2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cyp26b1Q811W2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyp26b1Q811W2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cyp26b1Q811W2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cyp26b1Q811W2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp26b1Q811W2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp26b1Q811W2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cyp26b1Q811W2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp26b1Q811W2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cyp26b1Q811W2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cyp26b1Q811W2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cyp26b1Q811W2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cyp26b1Q811W2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cyp26b1Q811W2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cyp26b1Q811W2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cyp26b1Q811W2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cyp26b1Q811W2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cyp26b1Q811W2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cyp26b1Q811W2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cyp26b1Q811W2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Cyp26b1Q811W2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cyp26b1Q811W2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cyp26b1Q811W2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cyp26b1Q811W2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cyp26b1Q811W2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp26b1Q811W2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp26b1Q811W2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cyp26b1Q811W2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp26b1Q811W2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cyp26b1Q811W2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cyp26b1Q811W2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cyp26b1Q811W2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Cyp26b1Q811W2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cyp26b1Q811W2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cyp26b1Q811W2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp26b1Q811W2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cyp26b1Q811W2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp26b1Q811W2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp26b1Q811W2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp26b1Q811W2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp26b1Q811W2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cyp26b1Q811W2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp26b1Q811W2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp26b1Q811W2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cyp26b1Q811W2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp26b1Q811W2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cyp26b1Q811W2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cyp26b1Q811W2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cyp26b1Q811W2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp26b1Q811W2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cyp26b1Q811W2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cyp26b1Q811W2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cyp26b1Q811W2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Cyp26b1Q811W2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cyp26b1Q811W2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cyp26b1Q811W2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp26b1Q811W2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cyp26b1Q811W2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms