Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Liat1Q810M6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Liat1Q810M6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Liat1Q810M6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Liat1Q810M6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Liat1Q810M6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Liat1Q810M6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Liat1Q810M6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Liat1Q810M6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Liat1Q810M6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Liat1Q810M6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Liat1Q810M6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Liat1Q810M6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Liat1Q810M6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Liat1Q810M6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Liat1Q810M6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Liat1Q810M6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Liat1Q810M6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Liat1Q810M6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Liat1Q810M6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Liat1Q810M6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Liat1Q810M6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Liat1Q810M6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Liat1Q810M6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Liat1Q810M6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Liat1Q810M6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Liat1Q810M6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Liat1Q810M6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Liat1Q810M6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Liat1Q810M6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Liat1Q810M6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Liat1Q810M6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Liat1Q810M6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Liat1Q810M6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Liat1Q810M6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Liat1Q810M6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Liat1Q810M6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Liat1Q810M6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Liat1Q810M6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Liat1Q810M6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Liat1Q810M6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Liat1Q810M6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Liat1Q810M6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Liat1Q810M6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Liat1Q810M6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Liat1Q810M6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Liat1Q810M6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Liat1Q810M6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Liat1Q810M6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Liat1Q810M6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Liat1Q810M6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Liat1Q810M6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Liat1Q810M6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Liat1Q810M6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Liat1Q810M6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Liat1Q810M6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Liat1Q810M6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Liat1Q810M6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Liat1Q810M6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Liat1Q810M6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Liat1Q810M6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Liat1Q810M6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Liat1Q810M6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Liat1Q810M6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Liat1Q810M6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Liat1Q810M6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Liat1Q810M6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Liat1Q810M6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Liat1Q810M6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Liat1Q810M6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Liat1Q810M6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Liat1Q810M6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Liat1Q810M6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Liat1Q810M6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Liat1Q810M6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Liat1Q810M6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Liat1Q810M6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Liat1Q810M6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Liat1Q810M6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Liat1Q810M6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Liat1Q810M6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Liat1Q810M6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Liat1Q810M6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Liat1Q810M6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Liat1Q810M6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Liat1Q810M6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms