Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Stkld1Q80YS9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stkld1Q80YS9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Stkld1Q80YS9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stkld1Q80YS9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Stkld1Q80YS9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Stkld1Q80YS9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stkld1Q80YS9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Stkld1Q80YS9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stkld1Q80YS9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Stkld1Q80YS9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Stkld1Q80YS9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Stkld1Q80YS9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Stkld1Q80YS9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stkld1Q80YS9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Stkld1Q80YS9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stkld1Q80YS9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Stkld1Q80YS9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Stkld1Q80YS9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stkld1Q80YS9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Stkld1Q80YS9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Stkld1Q80YS9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Stkld1Q80YS9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stkld1Q80YS9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stkld1Q80YS9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Stkld1Q80YS9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Stkld1Q80YS9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stkld1Q80YS9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stkld1Q80YS9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stkld1Q80YS9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stkld1Q80YS9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Stkld1Q80YS9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stkld1Q80YS9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Stkld1Q80YS9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stkld1Q80YS9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stkld1Q80YS9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Stkld1Q80YS9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stkld1Q80YS9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stkld1Q80YS9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stkld1Q80YS9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Stkld1Q80YS9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Stkld1Q80YS9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Stkld1Q80YS9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms