Protein–RNA interactions for Protein: Q80XS6

Samd4b, Protein Smaug homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4bQ80XS6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd4bQ80XS6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd4bQ80XS6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd4bQ80XS6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd4bQ80XS6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Samd4bQ80XS6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Samd4bQ80XS6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Samd4bQ80XS6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samd4bQ80XS6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Samd4bQ80XS6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd4bQ80XS6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Samd4bQ80XS6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd4bQ80XS6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd4bQ80XS6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Samd4bQ80XS6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd4bQ80XS6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd4bQ80XS6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd4bQ80XS6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Samd4bQ80XS6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Samd4bQ80XS6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd4bQ80XS6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd4bQ80XS6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd4bQ80XS6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd4bQ80XS6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Samd4bQ80XS6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd4bQ80XS6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd4bQ80XS6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd4bQ80XS6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Samd4bQ80XS6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Samd4bQ80XS6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd4bQ80XS6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Samd4bQ80XS6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd4bQ80XS6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Samd4bQ80XS6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Samd4bQ80XS6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd4bQ80XS6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms