Protein–RNA interactions for Protein: Q80XI1

Fbxo34, F-box only protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo34Q80XI1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fbxo34Q80XI1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo34Q80XI1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo34Q80XI1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo34Q80XI1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo34Q80XI1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo34Q80XI1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fbxo34Q80XI1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo34Q80XI1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo34Q80XI1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fbxo34Q80XI1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo34Q80XI1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo34Q80XI1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fbxo34Q80XI1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fbxo34Q80XI1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fbxo34Q80XI1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo34Q80XI1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo34Q80XI1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo34Q80XI1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo34Q80XI1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo34Q80XI1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo34Q80XI1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo34Q80XI1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo34Q80XI1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo34Q80XI1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo34Q80XI1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo34Q80XI1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo34Q80XI1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo34Q80XI1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo34Q80XI1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo34Q80XI1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo34Q80XI1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo34Q80XI1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms