Protein–RNA interactions for Protein: Q80W40

Acsm4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm4Q80W40 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Acsm4Q80W40 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acsm4Q80W40 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acsm4Q80W40 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acsm4Q80W40 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Acsm4Q80W40 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Acsm4Q80W40 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Acsm4Q80W40 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Acsm4Q80W40 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Acsm4Q80W40 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acsm4Q80W40 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acsm4Q80W40 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsm4Q80W40 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsm4Q80W40 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsm4Q80W40 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsm4Q80W40 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Acsm4Q80W40 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acsm4Q80W40 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acsm4Q80W40 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acsm4Q80W40 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsm4Q80W40 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsm4Q80W40 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsm4Q80W40 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsm4Q80W40 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsm4Q80W40 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsm4Q80W40 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsm4Q80W40 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsm4Q80W40 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsm4Q80W40 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsm4Q80W40 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsm4Q80W40 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsm4Q80W40 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsm4Q80W40 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Acsm4Q80W40 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acsm4Q80W40 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acsm4Q80W40 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acsm4Q80W40 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsm4Q80W40 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsm4Q80W40 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsm4Q80W40 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsm4Q80W40 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsm4Q80W40 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsm4Q80W40 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsm4Q80W40 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acsm4Q80W40 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acsm4Q80W40 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Acsm4Q80W40 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms