Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nup214Q80U93 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nup214Q80U93 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup214Q80U93 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup214Q80U93 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nup214Q80U93 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup214Q80U93 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup214Q80U93 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup214Q80U93 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nup214Q80U93 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nup214Q80U93 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup214Q80U93 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup214Q80U93 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nup214Q80U93 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup214Q80U93 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup214Q80U93 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup214Q80U93 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nup214Q80U93 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup214Q80U93 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nup214Q80U93 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup214Q80U93 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nup214Q80U93 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nup214Q80U93 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup214Q80U93 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup214Q80U93 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nup214Q80U93 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup214Q80U93 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nup214Q80U93 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nup214Q80U93 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nup214Q80U93 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nup214Q80U93 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup214Q80U93 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nup214Q80U93 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup214Q80U93 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup214Q80U93 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nup214Q80U93 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup214Q80U93 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup214Q80U93 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Nup214Q80U93 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup214Q80U93 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup214Q80U93 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nup214Q80U93 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup214Q80U93 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nup214Q80U93 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms