Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec18aQ7TSQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Clec18aQ7TSQ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec18aQ7TSQ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec18aQ7TSQ1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clec18aQ7TSQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clec18aQ7TSQ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec18aQ7TSQ1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec18aQ7TSQ1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec18aQ7TSQ1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec18aQ7TSQ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec18aQ7TSQ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec18aQ7TSQ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec18aQ7TSQ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec18aQ7TSQ1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clec18aQ7TSQ1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clec18aQ7TSQ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clec18aQ7TSQ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Clec18aQ7TSQ1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clec18aQ7TSQ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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