Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ClmQ7TSN2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ClmQ7TSN2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ClmQ7TSN2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ClmQ7TSN2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ClmQ7TSN2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ClmQ7TSN2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms