Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ShprhQ7TPQ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ShprhQ7TPQ3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ShprhQ7TPQ3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
ShprhQ7TPQ3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
ShprhQ7TPQ3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ShprhQ7TPQ3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ShprhQ7TPQ3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ShprhQ7TPQ3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ShprhQ7TPQ3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ShprhQ7TPQ3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ShprhQ7TPQ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ShprhQ7TPQ3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
ShprhQ7TPQ3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
ShprhQ7TPQ3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
ShprhQ7TPQ3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ShprhQ7TPQ3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
ShprhQ7TPQ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
ShprhQ7TPQ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
ShprhQ7TPQ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
ShprhQ7TPQ3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
ShprhQ7TPQ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
ShprhQ7TPQ3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ShprhQ7TPQ3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ShprhQ7TPQ3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
ShprhQ7TPQ3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
ShprhQ7TPQ3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
ShprhQ7TPQ3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ShprhQ7TPQ3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
ShprhQ7TPQ3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.34
ShprhQ7TPQ3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
ShprhQ7TPQ3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
ShprhQ7TPQ3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
ShprhQ7TPQ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
ShprhQ7TPQ3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ShprhQ7TPQ3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ShprhQ7TPQ3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ShprhQ7TPQ3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ShprhQ7TPQ3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
ShprhQ7TPQ3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ShprhQ7TPQ3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
ShprhQ7TPQ3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
ShprhQ7TPQ3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
ShprhQ7TPQ3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
ShprhQ7TPQ3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
ShprhQ7TPQ3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
ShprhQ7TPQ3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
ShprhQ7TPQ3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ShprhQ7TPQ3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
ShprhQ7TPQ3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
ShprhQ7TPQ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ShprhQ7TPQ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ShprhQ7TPQ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
ShprhQ7TPQ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
ShprhQ7TPQ3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ShprhQ7TPQ3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
ShprhQ7TPQ3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
ShprhQ7TPQ3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
ShprhQ7TPQ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
ShprhQ7TPQ3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ShprhQ7TPQ3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
ShprhQ7TPQ3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
ShprhQ7TPQ3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
ShprhQ7TPQ3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ShprhQ7TPQ3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
ShprhQ7TPQ3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ShprhQ7TPQ3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
ShprhQ7TPQ3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ShprhQ7TPQ3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ShprhQ7TPQ3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
ShprhQ7TPQ3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ShprhQ7TPQ3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
ShprhQ7TPQ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ShprhQ7TPQ3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
ShprhQ7TPQ3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ShprhQ7TPQ3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ShprhQ7TPQ3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
ShprhQ7TPQ3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ShprhQ7TPQ3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ShprhQ7TPQ3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ShprhQ7TPQ3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ShprhQ7TPQ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ShprhQ7TPQ3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
ShprhQ7TPQ3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ShprhQ7TPQ3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ShprhQ7TPQ3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ShprhQ7TPQ3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ShprhQ7TPQ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ShprhQ7TPQ3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ShprhQ7TPQ3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ShprhQ7TPQ3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ShprhQ7TPQ3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
ShprhQ7TPQ3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ShprhQ7TPQ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ShprhQ7TPQ3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ShprhQ7TPQ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ShprhQ7TPQ3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ShprhQ7TPQ3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ShprhQ7TPQ3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ShprhQ7TPQ3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms