Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Krt9Q6RHW0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Krt9Q6RHW0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Krt9Q6RHW0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Krt9Q6RHW0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Krt9Q6RHW0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt9Q6RHW0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt9Q6RHW0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Krt9Q6RHW0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Krt9Q6RHW0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krt9Q6RHW0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Krt9Q6RHW0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt9Q6RHW0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt9Q6RHW0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt9Q6RHW0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krt9Q6RHW0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Krt9Q6RHW0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt9Q6RHW0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt9Q6RHW0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt9Q6RHW0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krt9Q6RHW0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt9Q6RHW0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt9Q6RHW0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Krt9Q6RHW0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Krt9Q6RHW0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krt9Q6RHW0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt9Q6RHW0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt9Q6RHW0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt9Q6RHW0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krt9Q6RHW0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt9Q6RHW0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt9Q6RHW0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krt9Q6RHW0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krt9Q6RHW0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt9Q6RHW0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt9Q6RHW0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krt9Q6RHW0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt9Q6RHW0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krt9Q6RHW0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krt9Q6RHW0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krt9Q6RHW0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Krt9Q6RHW0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Krt9Q6RHW0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt9Q6RHW0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Krt9Q6RHW0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt9Q6RHW0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Krt9Q6RHW0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krt9Q6RHW0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms