Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
GcsamQ6RFH4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GcsamQ6RFH4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GcsamQ6RFH4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GcsamQ6RFH4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GcsamQ6RFH4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GcsamQ6RFH4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms