Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf4Q6PFF0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf4Q6PFF0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf4Q6PFF0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf4Q6PFF0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf4Q6PFF0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf4Q6PFF0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf4Q6PFF0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf4Q6PFF0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf4Q6PFF0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf4Q6PFF0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf4Q6PFF0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf4Q6PFF0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scaf4Q6PFF0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf4Q6PFF0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf4Q6PFF0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scaf4Q6PFF0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scaf4Q6PFF0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scaf4Q6PFF0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scaf4Q6PFF0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Scaf4Q6PFF0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf4Q6PFF0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf4Q6PFF0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf4Q6PFF0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf4Q6PFF0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf4Q6PFF0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scaf4Q6PFF0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf4Q6PFF0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scaf4Q6PFF0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf4Q6PFF0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf4Q6PFF0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf4Q6PFF0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf4Q6PFF0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf4Q6PFF0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf4Q6PFF0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf4Q6PFF0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf4Q6PFF0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf4Q6PFF0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf4Q6PFF0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf4Q6PFF0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf4Q6PFF0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms