Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rad54bQ6PFE3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad54bQ6PFE3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad54bQ6PFE3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad54bQ6PFE3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad54bQ6PFE3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad54bQ6PFE3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad54bQ6PFE3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad54bQ6PFE3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad54bQ6PFE3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad54bQ6PFE3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad54bQ6PFE3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad54bQ6PFE3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad54bQ6PFE3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad54bQ6PFE3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad54bQ6PFE3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rad54bQ6PFE3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad54bQ6PFE3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad54bQ6PFE3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad54bQ6PFE3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad54bQ6PFE3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad54bQ6PFE3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad54bQ6PFE3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad54bQ6PFE3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad54bQ6PFE3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad54bQ6PFE3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad54bQ6PFE3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad54bQ6PFE3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad54bQ6PFE3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad54bQ6PFE3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad54bQ6PFE3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rad54bQ6PFE3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad54bQ6PFE3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad54bQ6PFE3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad54bQ6PFE3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad54bQ6PFE3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad54bQ6PFE3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad54bQ6PFE3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad54bQ6PFE3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad54bQ6PFE3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad54bQ6PFE3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad54bQ6PFE3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad54bQ6PFE3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad54bQ6PFE3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad54bQ6PFE3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad54bQ6PFE3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad54bQ6PFE3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad54bQ6PFE3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad54bQ6PFE3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad54bQ6PFE3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad54bQ6PFE3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad54bQ6PFE3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rad54bQ6PFE3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad54bQ6PFE3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms