Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim37Q6PCX9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim37Q6PCX9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim37Q6PCX9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim37Q6PCX9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim37Q6PCX9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim37Q6PCX9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim37Q6PCX9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim37Q6PCX9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim37Q6PCX9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim37Q6PCX9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim37Q6PCX9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim37Q6PCX9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim37Q6PCX9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim37Q6PCX9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim37Q6PCX9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim37Q6PCX9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim37Q6PCX9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim37Q6PCX9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim37Q6PCX9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim37Q6PCX9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim37Q6PCX9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim37Q6PCX9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim37Q6PCX9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim37Q6PCX9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim37Q6PCX9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim37Q6PCX9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim37Q6PCX9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim37Q6PCX9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim37Q6PCX9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim37Q6PCX9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim37Q6PCX9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim37Q6PCX9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim37Q6PCX9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim37Q6PCX9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim37Q6PCX9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim37Q6PCX9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim37Q6PCX9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim37Q6PCX9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trim37Q6PCX9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim37Q6PCX9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim37Q6PCX9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim37Q6PCX9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim37Q6PCX9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim37Q6PCX9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim37Q6PCX9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim37Q6PCX9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim37Q6PCX9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim37Q6PCX9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim37Q6PCX9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim37Q6PCX9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim37Q6PCX9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim37Q6PCX9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim37Q6PCX9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim37Q6PCX9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Trim37Q6PCX9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim37Q6PCX9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim37Q6PCX9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim37Q6PCX9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Trim37Q6PCX9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim37Q6PCX9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim37Q6PCX9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim37Q6PCX9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim37Q6PCX9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim37Q6PCX9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim37Q6PCX9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim37Q6PCX9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim37Q6PCX9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim37Q6PCX9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim37Q6PCX9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim37Q6PCX9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms