Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5H6

Frmd5, FERM domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd5Q6P5H6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Frmd5Q6P5H6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Frmd5Q6P5H6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Frmd5Q6P5H6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmd5Q6P5H6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmd5Q6P5H6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Frmd5Q6P5H6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmd5Q6P5H6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Frmd5Q6P5H6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmd5Q6P5H6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmd5Q6P5H6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Frmd5Q6P5H6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Frmd5Q6P5H6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Frmd5Q6P5H6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmd5Q6P5H6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmd5Q6P5H6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Frmd5Q6P5H6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Frmd5Q6P5H6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Frmd5Q6P5H6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmd5Q6P5H6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Frmd5Q6P5H6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmd5Q6P5H6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmd5Q6P5H6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Frmd5Q6P5H6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Frmd5Q6P5H6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmd5Q6P5H6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Frmd5Q6P5H6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frmd5Q6P5H6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Frmd5Q6P5H6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frmd5Q6P5H6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Frmd5Q6P5H6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmd5Q6P5H6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmd5Q6P5H6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Frmd5Q6P5H6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Frmd5Q6P5H6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Frmd5Q6P5H6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Frmd5Q6P5H6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Frmd5Q6P5H6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frmd5Q6P5H6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frmd5Q6P5H6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Frmd5Q6P5H6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Frmd5Q6P5H6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmd5Q6P5H6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmd5Q6P5H6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmd5Q6P5H6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmd5Q6P5H6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Frmd5Q6P5H6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Frmd5Q6P5H6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmd5Q6P5H6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmd5Q6P5H6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Frmd5Q6P5H6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmd5Q6P5H6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Frmd5Q6P5H6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Frmd5Q6P5H6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Frmd5Q6P5H6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Frmd5Q6P5H6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Frmd5Q6P5H6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Frmd5Q6P5H6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Frmd5Q6P5H6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Frmd5Q6P5H6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Frmd5Q6P5H6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Frmd5Q6P5H6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Frmd5Q6P5H6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmd5Q6P5H6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Frmd5Q6P5H6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Frmd5Q6P5H6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmd5Q6P5H6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmd5Q6P5H6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Frmd5Q6P5H6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmd5Q6P5H6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Frmd5Q6P5H6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms