Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casc4Q6P2L7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Casc4Q6P2L7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Casc4Q6P2L7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casc4Q6P2L7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casc4Q6P2L7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Casc4Q6P2L7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Casc4Q6P2L7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Casc4Q6P2L7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Casc4Q6P2L7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Casc4Q6P2L7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casc4Q6P2L7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Casc4Q6P2L7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Casc4Q6P2L7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Casc4Q6P2L7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Casc4Q6P2L7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casc4Q6P2L7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Casc4Q6P2L7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Casc4Q6P2L7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Casc4Q6P2L7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casc4Q6P2L7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casc4Q6P2L7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Casc4Q6P2L7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Casc4Q6P2L7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc4Q6P2L7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc4Q6P2L7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Casc4Q6P2L7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Casc4Q6P2L7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Casc4Q6P2L7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casc4Q6P2L7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Casc4Q6P2L7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Casc4Q6P2L7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casc4Q6P2L7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casc4Q6P2L7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casc4Q6P2L7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Casc4Q6P2L7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Casc4Q6P2L7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Casc4Q6P2L7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms